Od prvého prípadu koronavírusovej choroby v decembri 2019 sa pandemická choroba rozšírila na milióny ľudí na celom svete.Táto globálna pandémia románuťažký akútny respiračný syndróm koronavírus 2 (SARS-CoV-2)je jednou z najpôsobivejších a najzaujímavejších globálnych zdravotných kríz modernej doby, ktorá predstavuje veľkú hrozbu pre svet a ovplyvňuje všetky aspekty ľudského života.[1]
Koronavírusy sú obalené jednovláknové RNA vírusy s pozitívnym zmyslom z čeľade Coronaviridae, ktoré majú široké spektrum hostiteľov, ako sú ľudia, netopiere, ťavy a vtáčie druhy vrátane hospodárskych zvierat a spoločenských zvierat, čo predstavuje hrozbu pre verejné zdravie. 1 Koronavírusy sú klasifikované v podčeľade Orthocoronavirinae, ktorá sa ďalej delí na štyri rody na základe rozdielov v proteínových sekvenciách: a-koronavírus, b-koronavírus, g-koronavírus a d-koronavírus.a-koronavírusy a b-koronavírusy infikujú iba cicavce, zatiaľ čo g-koronavírusy a d-koronavírusy primárne infikujú vtáky, hoci niektoré z nich môžu infikovať cicavce.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV a SARS-CoV-2 je sedem koronavírusov, u ktorých sa zistilo, že infikujú ľudí.Spomedzi nich sú SARSCoV a MERS-CoV, ktoré sa objavili v ľudskej populácii v rokoch 2002 a 2012, vysoko patogénne.Zatiaľ čo kmene ľudského koronavírusu (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 alebo HCoV-HKU1 cirkulujúce v ľudskej populácii spôsobujú iba bežné prechladnutie,7 koronavírus ťažkého akútneho respiračného syndrómu 2 (SARS-CoV2), pôvodcu ochorenia COVID-19 je nový b-koronavírus, ktorý sa objavil na konci roka 2019 a mal za následok ničivé úmrtia.Primárne príznakyCOVID-19sú podobné ako pri SARS-CoV a MERS-CoV: horúčka, únava, suchý kašeľ, bolesť v hornej časti hrudníka, niekedy hnačka a dýchavičnosť.Na rozdiel od minulostiinfekcie koronavírusom (CoV).rýchle globálne šírenie, vysoká miera prenosu, dlhší inkubačný čas, viac asymptomatických infekcií a závažnosť ochorenia SARS-CoV-2 si vyžadujú hlboké znalosti o stratégiách vírusového imunitného úniku.
Podobne ako iné ľudské koronavírusy (SARS-CoV-2, MERS-CoV), aj SARSCoV-2 má jednovláknový, pozitívny RNA genóm s veľkosťou približne 30 kb.Ako je znázornené na obrázku 1, vírusové nukleokapsidové (N) proteíny spájajú genóm do veľkého ribonukleoproteínového (RNP) komplexu, ktorý je potom obalený lipidmi a vírusovými proteínmi S (špica), M (membrána) a E (obal).50. koniec genómu má dva veľké otvorené čítacie rámce (ORF), ORF1a a ORF1b, kódujúce polypeptidy pp1a a pp1b, ktoré sú produkované do 16 neštrukturálnych proteínov (NSP) zahŕňajúcich každý aspekt vírusovej replikácie vírusovými proteázami NSP3 a NSP5, ktoré obsahujú proteázovú doménu podobnú papaínu a proteázovú doménu podobnú 3C.9 30. koniec genómu kóduje štrukturálne proteíny a doplnkové proteíny, z ktorých ORF3a, ORF6, ORF7a a ORF7b sa ukázali ako zahrnuté vírusové štrukturálne proteíny pri tvorbe vírusových častíc a ORF3b a ORF6 fungujú ako antagonisty interferónu.Podľa súčasnej anotácie na základe sekvenčnej podobnosti s inými b-koronavírusmi SARS-CoV-2 zahŕňa predpovede šiestich doplnkových proteínov (3a, 6, 7a, 7b, 8 a 10).Nie všetky tieto ORF však ešte neboli experimentálne overené a presný počet doplnkových génov SARS-CoV-2 je stále predmetom sporu.Preto stále nie je jasné, ktoré doplnkové gény sú skutočne exprimované týmto kompaktným genómom.[2]
Vysoko citlivé a špecifické testy sú kľúčové na identifikáciu a zvládanie pacientov s COVID-19, ako aj na implementáciu kontrolných opatrení na obmedzenie prepuknutia.Molekulárne testy POC (point-of-care) majú potenciál umožniť skoršiu detekciu a2 izoláciu potvrdených prípadov SARS-CoV-2 v porovnaní s laboratórnymi diagnostickými metódami, čím sa zníži prenos v domácnostiach a komunitách.
[1]Klinický a operačný vplyv rýchlej detekcie SARS-CoV-2 na mieste starostlivosti na pohotovostnom oddelení
[2] Boj medzi hostiteľom a SARS-CoV-2: Vrodená imunita a stratégie vyhýbania sa vírusom
Čas odoslania: 25. mája 2022